War Rottenacker lange Zeit nach der Reformation ausschließlich evangelisch, so haben sich in den letzten Jahrzehnten insbesondere durch industriell bedingten Zuzug die Konfessionsverhältnisse verändert. Heute sind ca. 55 % evangelisch, ca. 30 % sind katholisch und 15 % haben eine andere oder gar keine Konfession. Im Ort wird eine gute Ökumene gelebt.